Kegiatan kerohanian di SMPN 3 Sidoarjo sudah sering dilakukan. Setiap Jum’at secara bergilir murid laki-laki mengikuti Sholat Jum’at, dan untuk perempuan dilakukan pada hari sabtu saat Shalat Dhuhur berlangsung. Namun saat pengembangan diri dilakukan terlebih dahulu yakni Shalat Dhuha. Kegiatan ini dilakukan untuk meningkatkan nilai.nilai religius dikalangan murid SMPN 3 Sidoarjo.
Selain itu, saat menjelang UN, para siswa Muslim kelas 3 mengikuti kegiatan Istigozah untuk menyiapkan mental para siswa kelas 3.
Ada pula kegiatan ujian praktek agama untuk menilai para siswa dalam kehidupan kerohanian mereka, seperti yang terlihat pada gambar dibawah, seorang guru yang sedang menilai para murid dalam ujian praktek.
Selain itu, saat menjelang UN, para siswa Muslim kelas 3 mengikuti kegiatan Istigozah untuk menyiapkan mental para siswa kelas 3.
Ada pula kegiatan ujian praktek agama untuk menilai para siswa dalam kehidupan kerohanian mereka, seperti yang terlihat pada gambar dibawah, seorang guru yang sedang menilai para murid dalam ujian praktek.
